Người ta chấp nhận rộng rãi rằng nơi cư trú đầu tiên của con người ở quần đảo Nhật Bản có thể được truy nguyên từ thời tiền sử. Thời kỳ Jōmon, được đặt tên theo đồ gốm "có dây", được theo sau bởi Yayoi trong thiên niên kỷ đầu tiên trước Công nguyên, khi các công nghệ mới được giới thiệu từ lục địa châu Á. Trong thời kỳ này, vào thế kỷ thứ nhất sau Công nguyên, tài liệu tham khảo đầu tiên được biết đến Nhật Bản đã được ghi vào Sách Hán của Trung Quốc. Giữa thế kỷ thứ tư đến thế kỷ thứ chín, nhiều vương quốc và bộ lạc của Nhật Bản dần dần được thống nhất dưới một chính phủ tập trung, do Hoàng đế kiểm soát. Vương triều được thành lập vào thời điểm này tiếp tục trị vì Nhật Bản cho đến ngày nay. Năm 794, một thủ đô đế quốc mới được thành lập tại Heian-kyō (Kyoto hiện đại), đánh dấu sự khởi đầu của thời kỳ Heian, kéo dài đến năm 1185. Thời kỳ Heian được coi là thời kỳ hoàng kim của văn hóa cổ điển Nhật Bản. Đời sống tôn giáo của Nhật Bản từ thời gian này trở đi là sự pha trộn của Phật giáo và các thực hành tôn giáo bản địa được gọi là Thần đạo.
Trong những thế kỷ tiếp theo, quyền lực của Hoàng đế và triều đình dần dần suy giảm và được truyền lại cho các gia tộc quân đội và quân đội của các chiến binh samurai. Gia tộc Minamoto dưới thời Minamoto no Yoritomo nổi lên chiến thắng từ Cuộc chiến Genpei năm 1180. Sau khi nắm quyền, Yoritomo đã thiết lập thủ đô của mình ở Kamakura và lấy danh hiệu tướng quân. Vào năm 1274 và 1281, Mạc phủ Kamakura đã chống lại hai cuộc xâm lược của người Mông Cổ, nhưng vào năm 1333, nó đã bị lật đổ bởi một người yêu sách đối với Mạc phủ, mở ra thời Muromachi. Trong thời Muromachi, các lãnh chúa khu vực được gọi là daimyō đã nắm quyền lực với chi phí của tướng quân. Cuối cùng, Nhật Bản rơi vào thời kỳ nội chiến. Trong suốt cuối thế kỷ XVI, Nhật Bản đã được thống nhất dưới sự lãnh đạo của daimyō Oda Nobunaga và người kế vị Toyotomi Hideyoshi. Sau cái chết của Hideyoshi năm 1598, Tokugawa Ieyasu lên nắm quyền và được Hoàng đế bổ nhiệm làm tướng quân. Mạc phủ Tokugawa, cai quản từ Edo (Tokyo hiện đại), chủ trì một kỷ nguyên thịnh vượng và hòa bình được gọi là thời Edo (1600 giật1868). Mạc phủ Tokugawa áp đặt một hệ thống giai cấp nghiêm ngặt đối với xã hội Nhật Bản và cắt đứt gần như mọi liên lạc với thế giới bên ngoài.
Ứng dụng này là về lịch sử và cho mục đích nghiên cứu.