Tom Sawyer là một cậu bé sống với dì Polly của mình trên bờ sông Mississippi. Anh ấy có vẻ thích gặp rắc rối nhất. Sau khi nghỉ học một ngày (và đánh nhau), Tom bị trừng phạt với nhiệm vụ quét vôi hàng rào. Tuy nhiên, anh ta biến hình phạt thành một trò giải trí và lừa các cậu bé khác để hoàn thành công việc cho mình. Anh ấy thuyết phục các chàng trai rằng công việc vặt là một vinh dự lớn, vì vậy anh ấy nhận được những vật nhỏ, quý giá để thanh toán.
Vào khoảng thời gian này, Tom phải lòng một cô gái trẻ, Becky Thatcher. Anh ấy phải chịu đựng một cuộc tình lãng mạn và đính hôn với cô ấy trước khi cô ấy xa lánh anh ấy sau khi nghe tin Tom đính hôn trước đó với Amy Lawrence. Anh ta cố gắng giành lại Becky, nhưng mọi chuyện không suôn sẻ. Cô từ chối một món quà mà anh ta cố gắng tặng cô. Xấu hổ, Tom bỏ chạy và mơ một kế hoạch bỏ trốn.
Đó là khoảng thời gian Tom tình cờ gặp Huckleberry Finn, người sẽ là nhân vật chính trong cuốn tiểu thuyết tiếp theo và được hoan nghênh nhất của Twain. Huck và Tom đồng ý gặp nhau ở nghĩa địa vào lúc nửa đêm để thử nghiệm kế hoạch chữa mụn cóc liên quan đến một con mèo chết.
Các chàng trai gặp nhau tại nghĩa địa, nơi đưa cuốn tiểu thuyết đến khung cảnh quan trọng khi họ chứng kiến một vụ giết người. Injun Joe giết Tiến sĩ Robinson và cố gắng đổ lỗi nó cho Muff Porter say rượu. Injun Joe không biết rằng các chàng trai đã thấy những gì anh ta làm.
Sợ hậu quả của việc biết được điều này, anh và Huck đã tuyên thệ im lặng. Tuy nhiên, Tom trở nên trầm cảm khi Muff vào tù vì tội giết Robinson.
Sau một lần bị Becky Thatcher từ chối, Tom và Huck bỏ chạy cùng với người bạn Joe Harper của họ. Họ ăn cắp một số thức ăn và đi đến Đảo của Jackson. Họ ở đó không lâu trước khi họ phát hiện ra một nhóm tìm kiếm đang tìm kiếm ba cậu bé được cho là đã chết đuối và nhận ra họ là những cậu bé đang được nghi vấn.
Họ chơi trò đố chữ một lúc và không để lộ bản thân cho đến khi "đám tang" của họ, tiến vào nhà thờ trước sự ngạc nhiên và kinh ngạc của gia đình họ.
Tom tiếp tục tán tỉnh Becky nhưng không thành công trong kỳ nghỉ hè. Cuối cùng, vượt qua mặc cảm tội lỗi, anh ta làm chứng tại phiên tòa xét xử Muff Potter, minh oan cho tội giết người của Robinson. Potter được trả tự do, và Injun Joe trốn thoát qua một cửa sổ trong phòng xử án.
Tuy nhiên, phiên tòa không phải là cuộc gặp cuối cùng của Tom với Injun Joe. Trong phần cuối của cuốn tiểu thuyết, anh và Becky (mới tái hợp) bị lạc vào một trong những hang động. Tại đây, Tom tình cờ gặp kẻ thù không đội trời chung của mình. Thoát khỏi nanh vuốt của anh ta và tìm đường ra, Tom xoay sở để báo cho người dân thị trấn, những người đã khóa hang trong khi để Injun Joe ở bên trong.
Tuy nhiên, anh hùng của chúng ta kết thúc có hậu, khi anh ta và Huck phát hiện ra một hộp vàng (từng thuộc về Injun Joe), và số tiền được đầu tư cho họ. Tom tìm thấy hạnh phúc và - phần lớn nỗi đau của anh ấy - Huck tìm thấy sự tôn trọng khi được nhận làm con nuôi.