Nó xác định chất lượng amoniac được sản xuất trong hệ thống nuôi trồng thủy sản nhờ sự bài tiết trực tiếp từ cá và phân hủy các hợp chất hữu cơ bằng vi khuẩn hetrotrophic như hợp chất vô cơ đầu tiên được tạo ra thông qua chu trình nitơ, sau đó bị ôxy hóa thành nitrat (NO2). chủ yếu thường được biết đến chi trong đó là Nitrosomonas. Nitrat sau đó được oxy hóa thêm bởi một số nhóm vi khuẩn, chủ yếu được biết đến rộng rãi trong Nitrobacter, nitrate (NO3). Tốc độ chuyển đổi amoniac thành nitrat phụ thuộc vào nồng độ nitơ trong nước, nồng độ oxy, nồng độ hữu cơ trong nước trong bộ lọc, nhiệt độ và các biến số khác.
Amoniac là sản phẩm cuối cùng của sự phân hủy protein trong cá. Cá tiêu hóa protein trong thức ăn của chúng và thải ra amoniac qua mang và trong phân của chúng. Lượng amoniac thải ra từ cá thay đổi theo lượng thức ăn đưa vào ao nuôi hoặc hệ thống nuôi, tăng khi tỷ lệ cho ăn tăng lên. Amoniac cũng đi vào ao do vi khuẩn phân hủy các chất hữu cơ như thức ăn thừa hoặc tảo chết và thực vật thủy sinh.