CINDER cho máy tính PC Windows

Tinh thể Protein là một phần thiết yếu của tinh thể học tia X, phương pháp chủ yếu được sử dụng để tìm ra các cấu trúc phân tử của các phân tử sinh học quan trọng như protein. CSIRO (cũng như nhiều cơ quan nghiên cứu khác) là quan tâm đến các cấu trúc phân tử của protein vì nó là điều cần thiết cho nghiên cứu công nghệ sinh học của chúng tôi.
Tìm tinh thể protein mất rất nhiều thời gian!

Để phát triển một tinh thể protein, CSIRO phải đặt lên hàng ngàn thí nghiệm kết tinh. Những thí nghiệm này là giọt nước nhỏ, nơi các hỗn hợp khác nhau của các hóa chất này được kết hợp với một mẫu protein tinh khiết tập trung. Thật không may, không có cách nào biết được có sự kết hợp của các chất hóa học sẽ làm việc cho bất kỳ loại protein đặc biệt, vì vậy cho mỗi protein, nhiều giọt khác nhau được thiết lập. Sau đó, chúng ta có hình ảnh của các thí nghiệm sau nhiều tuần, và nhìn vào chúng để xem có tinh thể được hình thành. Ít hơn 1% của các thí nghiệm có các tinh thể. CSIRO phát triển Cinder vì vậy chúng tôi có thể lấn nguồn tìm kiếm của chúng tôi cho các thí nghiệm với các tinh thể. Chúng tôi đang sử dụng thông tin này để giúp chúng tôi phát triển các công cụ phân tích hình ảnh máy tính để giúp chúng tôi tìm thấy các tinh thể tự động. (Một cách tiếp cận tương tự đã được sử dụng bởi Facebook để kích hoạt nó nhận ra khuôn mặt của mọi người trong ảnh).

Một trong những thách thức là tinh thể có thể phát triển theo nhiều cách khác nhau, và trong nhiều hình dạng khác nhau. Khi chúng ta nghĩ về tinh chúng ta nghĩ về một cái gì đó giống như một hạt muối, hoặc của một viên kim cương. Nhưng tinh thể cũng có thể được kéo dài và mỏng (như spaghetti) hoặc cụm kim tiêm nhỏ - giống như một con nhím biển. Các tinh thể có thể lớn và thực sự dễ dàng để phát hiện, hoặc họ có thể được ẩn trong một đám mây của protein kết tủa (gần giống như một màn sương mù). Như vậy chương trình máy tính của chúng tôi sử dụng để tìm tinh thể không thể chỉ nhìn cho một loại tinh thể, nhưng đã được đào tạo về một tập lớn các hình ảnh khác nhau, một số có tinh thể, một số không có tinh thể. Con người là rất tốt trong việc tìm ra các tinh thể trong hình ảnh, và chúng tôi đã phát triển Cinder để bạn có thể giúp chúng tôi tạo ra các tập huấn luyện mà sẽ được sử dụng để giúp các chương trình máy tính tìm hiểu làm thế nào để tìm thấy tinh thể.

Cinder là một ứng dụng dễ sử dụng, trượt sang phải cho tinh thể. Phân loại của mỗi thí nghiệm được đẩy trở lại CSIRO.

Các tinh thể, chúng tôi tìm thấy sẽ được sử dụng để tạo ra các cấu trúc nguyên tử của các protein, được sử dụng để giúp các nhà khoa học hiểu được protein. Cấu trúc nguyên tử được tạo ra thông qua X-quang tinh thể đã được sử dụng để hiểu làm thế nào DNA hoạt động, phát triển các loại thuốc chống lại các bệnh như HIV, và để lộ cơ sở phân tử của sự quang hợp.

Mỗi swipe từ bạn là giúp chúng ta phát triển một sự hiểu biết tốt hơn về sinh học!

- Updated score colours to reflect the main See3 tool.
- Added option to change the URL for the Solo mode API
- Fixed a bug where the previously scored image was displayed for a moment before changing.
- Added well name to the details image in the Solo mode