Đại học Manipur được thành lập vào ngày 5 tháng 6 năm 1980, theo Đạo luật Đại học Manipur 1980 (Đạo luật Manipur 8 năm 1980), là một trường đại học giảng dạy kiêm liên kết tại Imphal với quyền tài phán lãnh thổ đối với bang Manipur. Nó đã được chuyển đổi thành một trường đại học trung tâm w.e.f. Ngày 13 tháng 10 năm 2005. Đạo luật số 55 của Đại học Manipur năm 2005 đã nhận được sự đồng ý của tổng thống vào ngày 28 tháng 12 năm 2005.
Trường đại học ở Canchipur, cách Imphal, thủ đô của Manipur, Ấn Độ khoảng 7 km. Khuôn viên được trải rộng trên diện tích 287 mẫu Anh (1,16 km2) tại Canchipur lịch sử, cung điện cũ của vương quốc Manipur. Cung điện Langthabal (Konung) được thành lập bởi Maharaja Gambhir Singh vào năm 1827 (tháng 10) ngay sau khi Manipur giải phóng khỏi sự chiếm đóng của Miến Điện. Maharaja Gambhir Singh trút hơi thở cuối cùng ở Canchipur.