Jutsu được chia thành ba loại chính: ninjutsu, genjutsu và taijutsu. Ninjutsu có hai tiểu thể loại: niêm phong thuật và bí mật con dấu thuật, cả hai đều được sử dụng để làm con dấu trong các mục đích khác nhau. Senjutsu, một khái niệm được giới thiệu trong Naruto Phần II, sử dụng ba loại năng lượng: năng lượng tinh thần và thể chất của shinobi của người mặc và năng lượng tự nhiên của người mặc. Bằng cách truyền năng lượng tự nhiên, việc sử dụng senjutsu có thể làm tăng sức mạnh của thuật khác. Ngoài ra, có khả năng genkai kekkei được truyền từ thế hệ này sang thế hệ khác thông qua quan hệ máu và cho phép người dùng thực hiện một số kỹ thuật nhất định.
Mỗi thuật có 6 phân loại, cụ thể là: